Skip to main content

Table 2 Positively correlated DARs and DEGs in 4 sets of samples

From: Integrative analysis based on ATAC-seq and RNA-seq reveals a novel oncogene PRPF3 in hepatocellular carcinoma

O1

 chr1:150293602-150294101|PRPF3

 chr1:224517860-224518359|NVL

 chr3:53254130-53254629|TKT

 chr6:1310125-1310624|FOXQ1

 chr6:21589209-21589708|SOX4

 chr8:144465665-144466164|RHPN1

 chr9:19127338-19127837| PLIN2

O2

 chr1:149899329-149899828|SF3B4

 chr1:150293602-150294101|PRPF3

 chr1:151763269-151763768|TDRKH

 chr8:144373630-144374129|ZNF696

 chr9:19127338-19127837|PLIN2

O3

 chr1:149899329-149899828| SF3B4

 chr1:150293602-150294101| PRPF3

 chr1:151254500-151254999| ZNF687

 chr1:155243105-155243604| CLK2

 chr1:232765461-232765960| SIPA1L2

 chr5:41870193-41870692| OXCT1

 chr6:31830301-31830800| NEU1

 chr6:31865336-31865835| EHMT2

 chr9:19127338-19127837| PLIN2

O4

 chr1:45204900-45205399|KIF2C

 chr1:149899329-149899828|SF3B4

 chr1:150293602-150294101|PRPF3

 chr1:151763269-151763768|TDRKH

 chr1:155243105-155243604|CLK2

 chr1:224517860-224518359|NVL

 chr1:224544136-224544635|CNIH4

 chr1:232765461-232765960|SIPA1L2

 chr5:41870193-41870692|OXCT1

 chr8:144372780-144373279|ZNF696

 chr9:19127338-19127837|PLIN2

 chr17:40075464-40075963|ACLY

 chr19:2475772-2476271|GADD45B

Back to article page

Clinical Epigenetics

ISSN: 1868-7083

Contact us